シークエンス

準備するもの
    【器具】

  • PCR機 (Takara PCR Thermal Cyclerなど)
  • PCR用チューブ
  • ヒートブロック
  • オートシークエンサー (ABI 310 など)

    【試薬】

  • BigDye Terminator? v1.1 Cycle sequencing kit (Applied Biosystems)
  • 任意のプライマー (1.6μM)
  • Hi-Di (ホルムアミド溶液)
  • 100% EtOH, 70% EtOH
  • milliQ

プロトコール
<シークエンス反応>
  1. 目的の遺伝子を組み込んだプラスミドDNAを調製する。DNAは1サンプルにつき ?500ng 必要。
  2. 下の様に反応液を混合する。
  3. 下のサイクルでPCR 反応を行う。
    Takara PCR Thermal Cyclerの場合
    96 ℃   1分   1サイクル
    96 ℃  30秒
    50 ℃  15秒
    60 ℃  2分   25サイクル
  4. PCRが終了したら、反応液に100% EtOH 64μl、MQ 26μlを加えよく撹拌し、室温で15分静置する。
  5. 15,000 rpm、15分間、室温で遠心分離し、上清を捨てる。
  6. 70% EtOH 100μlを加え、15,000 rpm、10分間、4℃で遠心し、上清を捨てる。
  7. 沈殿を乾燥させ、Hi-Di 20μlを加え、ピペッティングにより沈殿を溶解させる。
  8. 95℃、2分間加熱し、すぐに氷中に戻す。
  9. オートシークエンサー (ABI 310) にかける。


 
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